W drugiej części niniejszego opracowania omówione zostaną choroby o przebiegu przewlekłym, czyli długotrwałym. Dziecko chorujące na schorzenie przewlekłe wymaga starannej opieki, systematycznego podawanie leków. W przypadku wszystkich chorób przewlekłych istotne jest zapobieganie zaostrzeniom, w tym ochrona przed infekcjami. Wskazane są dodatkowe szczepienia, np. przeciwko grypie. Należy je rozważyć także u pozostałych domowników – nazywa się to „strategią kokonu”. Choroby o ostrym przebiegu zostały omówione w części pierwszej.