Endometrioza na wielu etapach może wpływać na zaburzenia procesów rozrodu. Może powodować zakłócenia w funkcjonowaniu jajników, jajowodów czy innych narządów miednicy. Nawet w łagodnych odmianach endometriozy może dochodzić do trudności w implantacji zarodka w jamie macicy. Rozpoznanie niekiedy bywa trudne i wymaga czasu. Diagnostyka zawiera badanie ginekologiczne, badania obrazowe oraz w niektórych przypadkach laparoskopię.